Pribadi
Agus Fatoni menikahi A. P Widyaningtyas dan memiliki tiga anak bernama Adien, Are, dan Asa. Ketiga anaknya menempuh pendidikan di pondok pesantren tahfidz. Anak pertama dan kedua telah menyelesaikan pendidikan perguruan tinggi pilihannya.
Agus diketahui menjabat sebagai Penjabat Gubernur Sumatera Selatan (Sumsel) sejak Oktober 2023. Ia menggantikan Gubernur dan Wakil Gubernur Sumsel, Herman Deru dan Mawardi Yahya, yang masa jabatannya telah berakhir. Selain itu, Agus Fatoni juga menjabat sebagai Dirjen Bina Keuangan Daerah di Kemendagri.